腸内細菌のうち身体にとってよい働きをするものを指します。乳酸菌やビフィズス菌が代表的なものです。善玉菌が多くなると腸内での発酵が進み、腸内環境が酸性傾向になります。酸性の環境では善玉菌が増えやすくなるため、腸内環境が整えられていきます。善玉菌が多くなると便が黄色くなり、臭いが弱くなり、便量が増え、便通もよくなるのでトイレで腸内の状態を確認することができます。
〔参照〕悪玉菌、腸内細菌、乳酸菌、ビフィズス菌