免疫は軍隊にたとえられることが多いのですが、強い軍隊であっても外敵と味方の区別ができないのでは、的確に外敵だけを攻撃することはできません。そこで免疫を有効に働かせて外敵と戦うためには、まずはレーダーに当たる外敵と味方を識別する能力が必要になります。免疫のレーダーの役目は自律神経や、ホルモン調整などを行っている中枢神経が担っています。
免疫を司っているのは免疫細胞と呼ばれる白血球とリンパ球で、白血球もリンパ球も血液中や細胞の周りなど全身をパトロールしています。そして、外敵を発見したら、そこに集まって処理を始めます。白血球は好中球とマクロファージに大きく分けられています。好中球は小さな白血球で、病原菌や有害物質などを食べるようにして内部に取り込んで分解・処理します。一つひとつは小さく、処理できる量も限られているものの、非常に数が多く、数の力で対応していて、好中球は軍隊でいえば軽装備しか持っていない歩兵に相当します。
マクロファージは大きな白血球で、数多くの外敵を内部に取り込む貪食をします。戦車のように大量の外敵と戦えるわけですが、好中球が単に外敵を食べて処理するのに対して、マクロファージは外敵の種類や強さ、処理の情報をサイン物質として外に出します。このサイン物質はサイトカインで、サインを受けて次により強い軍隊に当たるリンパ球が働き出します。このほかに、寄生虫の攻撃やアレルギー反応の抑制などをしている好酸球があります。
リンパ球にはＢ細胞とＴ細胞とがあります。Ｂ細胞は骨髄で増殖し、外敵に合わせた抗体を作り出して外敵と戦っています。抗体は１種類の外敵にだけ有効なもので、その抗体を作る情報はＢ細胞の中に組み込まれています。つまり、未知の外敵に対してＢ細胞は、あらかじめ対応できるだけの情報が膨大に準備されていることになるわけです。
Ｔ細胞は骨髄で作られたあと、胸腺で成熟して活動能力を高めていきます。Ｔ細胞には、その役目によってヘルパーＴ細胞、キラーＴ細胞、サプレッサーＴ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の４種類に分けられます。ヘルパーＴ細胞は、Ｂ細胞が抗体を作り出すのを助けています。キラーＴ細胞は、外敵を直接的に攻撃するミサイルにたとえられます。キラーＴ細胞は働きすぎて外敵だけでなく味方である自分の体の細胞を傷つけることがあります。これが免疫異常やアレルギーの原因となっていますが、働きすぎを抑えて免疫作用を調整するのがサプレッサーＴ細胞の役割となっています。ナチュラルキラー細胞は腫瘍を主に攻撃して破壊する働きをしています。